Depuis deux ans, l'ex-agent / tueur à gages de la CIA Jason Bourne et sa compagne Marie ont réussi à tromper leurs poursuivants au prix d'une vigilance sans faille, changeant périodiquement d'identité

Dans le second volet de ses aventures, l'ex-espion amnésique Jason Bourne avait retrouvé l'instigateur du programme Treadstone pour le liquider.