Thomas, 16 ans, se réveille dans un ascenseur. Il ne sait plus qui il est ni d'où il vient, et ne semble se rappeler que de son prénom.

Thomas et ses acolytes vont découvrir le monde extérieur ravagé par l'Apocalypse. Le Labyrinthe n'était que le début. La Terre Brûlée est leur seconde épreuve. Mais pourquoi doivent-ils combattre ?