Takéo et Kaede règnent en paix depuis 16 ans sur les Trois Pays. Mais Takéo n'a pas révélé à Kaede l'existence de son fils Hisao et la dernière phrase de la prophétie : la mort viendra par son fils.

Takeo, désormais héritier du puissant clan des Otori, s'est engagé à rejoindre les rangs criminels de la Tribu, reniant ainsi son éducation pacifique, abandonnant ce qui lui revient de droit, territoi

Japon, 1857 : le pays s'ouvre aux influences étrangères. Tsuru est une jeune femme ambitieuse qui rêve de devenir médecin.

Dans le Japon féodal, le jeune Shigeru, héritier du clan des Otori, est formé à l'art de la guerre et des complots. Après la bataille de Yaegahara, le père de Shigeru meurt et celui-ci pert son rang.

Au XIVe siècle, dans un Japon médiéval mythique, le jeune Takeo grandit au sein d'une communauté paisible qui condamne la violence. Mais celle-ci est massacrée par les hommes du clan des Tohan.

Takéo a rassemblé une armée à Terayama. Il rejoint Maruyama, le domaine dont Kaede est héritière, après avoir combattu un géant et vaincu les Tohan.