Peu après la fin de la guerre avec les Klingons et la réhabilitation de Michael Burnham, sept signaux rouges apparaissent un peu partout dans la galaxie. Le timing de ces signaux, juste après la guerre, et la puissance inimaginable pour les créer mettent Starfleet et la Fédération en alerte rouge. Le Capitaine Christopher Pike est affecté au commandement du Discovery avec pour mission de découvrir la nature exacte de ses signaux et la raison de leur apparition.