L'univers est en pleine mutation. Des événements se succèdent et bouleversent le paysage continuellement. Récemment, une espèce qui semblait destinée à supplanter les hommes a été brusquement décimée et est aujourd'hui menacée d'extinction. Tandis que la planète se remet à peine de cette terrible catastrophe, une autre tragédie frappe le peuple américain et jette l'opprobre sur la communauté super-héroÉique. Devant les violents mouvements de protestation de la population. le gouvernement vote la Loi de Recensement des Surhumains qui oblige tous les êtres supérieurs à se montrer au grand jour et à se mettre au service des autorités. "Dans quel camp êtes-vous ?" Une mesure aussi radicale ne pouvait que diviser les super-héros. C'est ainsi qu'Iran Man, Mister Fantastic et le Frelon se déclarent clairement en faveur de la nouvelle loi. Cependant, à la surprise générale, Captain America entre en résistance et défend la liberté de choisir de chacun. L'apparition de deux groupes soutenant des positions totalement opposées n'est que le début de ce qui restera dans les annales sous le nom de Civil War, la guerre civile. Parmi les héros pris dans la tourmente, figurent également les Quatre Fantastiques, Iran Man, le Punisher et bien d'autres. Dans quel camp se sont-ils rangés ?